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    為什么不能用質粒DNA抽提試劑來提取基因組DNA?

    發布時間: 2021-08-24  點擊次數: 3683次

    導讀

        為什么同樣抽提質粒DNA的試劑不能用來抽提基因組DNA呢?差別很大么?要買兩種試劑盒真是麻煩??!你還不要不相信,有小伙伴試過,還真沒抽提出來。今天小編就來和大家一起探究下原因!


    基因組DNA的抽提,一般不會用到質粒抽提的試劑盒,究其原因是由于兩者的原理*不同。兩者不都是DNA抽提么?其實關鍵在于這兩者在實驗的初始設計上就*不同。先給大家解釋一下質粒抽提吧。


    質粒抽提

    質粒抽提通常用的是堿裂解法,一般的試劑盒都會有 SolutionⅠ,SolutionⅡ,SolutionⅢ,有的還會有 SolutionⅣ,然后是過柱子。


    SolutionⅠ

        SolutionⅠ一般都是用來重懸菌液的,會加入RNaseⅠ,降解掉里面大腸桿菌的RNA。同時里面還會用Tris-HEI體系來維持一個pH,另外會加入較大量的EDTA,去螯合掉里面二價金屬離子,使菌體本身的DNase失活。其實用雙蒸水來代替SolutionⅠ問題也不大,關鍵就是把菌重懸起來就行。


    Solution Ⅱ

        Solution Ⅱ,一般來說主要成分有兩個,就是NaOH和SDS,NaOH主要是用于破壞細胞膜結構,強堿條件下,菌體的細胞壁結構、細胞的磷脂雙分子層和微囊結構的構相都會發生變化。而SDS在這里主要并不是起到裂解蛋白的作用,而是結合氨基酸,一般兩個氨基酸可以結合一個SDS分子。菌體裂解后,其實小片段的質粒已經釋放出來了,而大片段的基因組DNA還結合在蛋白質上。


    Solution Ⅲ

        Solution Ⅲ的主要成分是醋酸鉀/醋酸緩沖液。首先長時間強堿環境下,DNA會斷裂,所以需要用醋酸進行中和,而鉀離子可以與SDS產生沉淀反應,使可溶于水的十二烷基磺酸鈉變成不溶于水的十二烷基磺酸鉀。這樣結合蛋白質的PDS就被沉淀下來了,同樣基因組DNA也同樣被沉淀了下來,用硅膠吸附釋放在上清里的質粒,或者用無水乙醇對上清進行沉淀,即可獲得質粒的DNA。


    基因組DNA抽提

    而普通的基因組 DNA 抽提,首先是裂解,用離子型的蛋白變性劑:CTAB 或者 SDS 對細胞進行裂解(加不加蛋白酶 K 其實并不太要緊),破膜的同時使得 DNA 從蛋白上解離下來。 加入高鹽溶液使蛋白質沉淀。然后用酚仿,使蛋白質沉淀變性在水相油相間,并分離出的可溶性蛋白。上清用異丙醇將 DNA 沉淀下來,同時低溫加入一定量的一價陽離子,可加速 DNA 沉淀。這些能和上述的質粒抽提混為一談么?!當然不行??! 


    小伙伴們現在能明白為啥基因組 DNA 不能用質粒抽提的試劑了吧……




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